故事的主人公是反恐特戰隊隊長鐘原，他在執行任務中成功擊斃了猛犸組織的二號人物，卻因此引來了該組織的復仇行動。在解救妻子趙欣的過程中，鐘原不幸被注射了一種病毒，導致他倍受折磨。與此同時，DK生物公司的董事長江寒（何晟銘 飾）邀請趙欣（牟星 飾）及其父親參加公司的“有益菌”研究項目。趙欣是生化專業的高材生，也是鐘原的初戀情人。在鐘原所在的反恐指揮中心得知T國的請求后，決定派遣專家潛入DK公司調查。趙欣在失去愛子后主動請纓“退出現役”，深入虎穴，開始調查有關DK公司的情況。隨著一系列接連不斷的恐怖事件發生，一個名為“新紀元計劃”的陰謀逐漸浮出水面。鐘原盡管身處病痛之中，仍然率領喬大鵬、麥萌萌等特戰隊員，決定絕地出擊。在他的愛妻趙欣和五年前“失蹤”的戰友陸豪的協助下，他們成功粉碎了恐怖組織的連環陰謀和生化襲擊，揭露了江寒利用“有益菌”制造病毒的真實計劃。