故事緊接著上一集發展，小狗貝多芬和露西終于走到了一起，過上了幸福的生活，露西還為貝多芬生下了四只可愛的小狗，一家人其樂融融。然而，這四只小狗崽卻讓孩子們陷入了煩惱之中，如果讓爸爸知道家里一下子多了這四個小家伙，那還不非得翻了天不可。雖然挨了老爸一頓臭罵，但善良的布魯諾先生（凱文·杜恩 Kevin Dunn 飾）還是收留了貝多芬和露西的孩子們，一家人前往寧靜的小村開始了悠閑的度假。然而他們并不知道的是，布魯諾的前妻瑞吉娜（黛比·瑪扎 Debi Mazar 飾）早已經盯上了小狗崽們，她想將它們偷到手，賣掉大賺一筆。得知此事的貝多芬率先行動，帶領妻兒躲到了山中，瑞吉娜緊隨其后。